Enam strain SARS-CoV-2 – Sains Terkini

Laju mutasi SARS-CoV-2 tetap rendah. Di seluruh Eropa dan Italia, yang paling luas adalah strain G, sedangkan strain L dari Wuhan secara bertahap menghilang. Namun, mutasi ini tidak menimpa proses pengembangan vaksin yang efektif.

Virus yang menyebabkan pandemi COVID-19, SARS-CoV-2, menghadirkan setidaknya enam jenis. Terlepas dari mutasinya, virus menunjukkan sedikit variabilitas, dan ini adalah kabar baik bagi para peneliti yang bekerja pada vaksin yang layak.

Ini adalah hasil dari studi paling luas yang pernah dilakukan pada sekuensing SARS-CoV-2. Para peneliti di University of Bologna mengambil dari analisis 48.635 genom coronavirus, yang diisolasi oleh para peneliti di laboratorium di seluruh dunia. Studi ini dipublikasikan dalam jurnal Perbatasan dalam Mikrobiologi. Maka mungkin bagi para peneliti untuk memetakan penyebaran dan mutasi virus selama perjalanannya ke semua benua.


Hasil pertama sangat menggembirakan. Coronavirus menghadirkan sedikit variabilitas, sekitar tujuh mutasi per sampel. Flu biasa memiliki tingkat variabilitas yang lebih dari dua kali lipat.

"Coronavirus SARS-CoV-2 mungkin sudah dioptimalkan untuk memengaruhi manusia, dan ini menjelaskan perubahan evolusinya yang rendah," jelas Federico Giorgi, seorang peneliti di Unibo dan koordinator penelitian. "Ini berarti bahwa perawatan yang kami kembangkan, termasuk vaksin, mungkin efektif terhadap semua jenis virus."

Saat ini, ada enam jenis coronavirus. Yang asli adalah strain L, yang muncul di Wuhan pada Desember 2019. Mutasi pertamanya – strain S – muncul pada awal 2020, sementara, sejak pertengahan Januari 2020, kami memiliki strain V dan G. To galur tanggal G adalah yang paling luas: ia bermutasi menjadi galur GR dan GH pada akhir Februari 2020.

"Strain G dan turunannya GR dan GH sejauh ini merupakan yang paling luas, mewakili 74% dari semua sekuens gen yang kami analisis," kata Giorgi. "Mereka menyajikan empat mutasi, dua di antaranya mampu mengubah urutan protein RNA polimerase dan Spike virus. Karakteristik ini mungkin memfasilitasi penyebaran virus."

Jika kita melihat pada peta coronavirus, kita dapat melihat bahwa strain G dan GR adalah yang paling sering di Eropa dan Italia. Menurut data yang tersedia, galur GH tampaknya dekat dengan tidak adanya di Italia, sementara itu terjadi lebih sering di Prancis dan Jerman. Ini tampaknya mengkonfirmasi keefektifan metode penahanan bulan lalu.

Di Amerika Utara, galur yang paling luas adalah GH, sementara di Amerika Selatan kami menemukan galur GR lebih sering. Di Asia, di mana galur Wuhan L awalnya muncul, penyebaran galur G, GH dan GR meningkat. Strain ini mendarat di Asia hanya pada awal Maret, lebih dari sebulan setelah penyebarannya di Eropa.


Secara global, galur G, GH dan GR terus meningkat. Strain S dapat ditemukan di beberapa area terbatas di AS dan Spanyol. Strain L dan V secara bertahap menghilang.

Selain enam jenis virus korona utama ini, para peneliti mengidentifikasi beberapa mutasi yang jarang terjadi, yang, pada saat ini, tidak mengkhawatirkan tetapi harus dipantau.

"Mutasi genom yang langka kurang dari 1% dari semua genom yang diurutkan," menegaskan Giorgi. "Namun, sangat penting bagi kami untuk mempelajari dan menganalisisnya sehingga kami dapat mengidentifikasi fungsinya dan memantau penyebarannya. Semua negara harus berkontribusi pada penyebabnya dengan memberikan akses ke data tentang urutan genom virus."

Studi ini dipublikasikan dalam jurnal Perbatasan dalam Mikrobiologi dengan judul "Distribusi Geografis dan Genomik dari Mutasi SARS-CoV-2." Para penulisnya adalah Daniele Mercatelli dan Federico M. Giorgi, keduanya dari Departemen Farmasi dan Bioteknologi dari Universitas Bologna.

You may also like...

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.