Gen perilaku makan pada ikan mandarin diidentifikasi – Sains Terkini

Beberapa spesies ikan mandarin (Sinipercidae) adalah pemakan ikan murni, yang secara eksklusif memakan ikan remaja – juga spesies mereka sendiri. Sebuah tim peneliti yang dipimpin oleh Chinese Huazhong Agricultural University (HZAU) dan Leibniz-Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries (IGB) telah mendeskripsikan genom dari empat spesies ikan mandarin dan dengan demikian juga mengidentifikasi gen untuk perilaku makan kanibal. Pengetahuan tentang hubungan antara genom dan perilaku makan merupakan hal yang menarik untuk budidaya berkelanjutan.

Kebanyakan larva ikan memakan zooplankton kecil yang mudah dicerna. Tidak demikian halnya dengan beberapa spesies ikan mandarin. Ini adalah murni "pemakan ikan" setelah menetas dan memakan ikan muda dari spesies ikan lain dan sejenisnya. Kanibalisme ini menyebabkan tingginya angka kematian ikan remaja dan kerugian ekonomi dalam budidaya.


32 gen membuat perbedaan bagi kanibal

Para peneliti membandingkan urutan genom berbagai spesies ikan mandarin dan dengan demikian mampu melacak evolusi 20.000 gen selama 65 juta tahun. Mereka mampu menghubungkan banyak gen dengan karakteristik spesifik spesies. "Untuk 32 gen yang berkembang ini, kami dapat secara eksperimental mendemonstrasikan ekspresi gen yang berbeda pada spesies ikan mandarin yang sama dengan makanan lain dan pada spesies pemakan ikan murni," jelas Ling Li, salah satu penulis pertama studi dan tamu tersebut. ilmuwan dari HZAU di IGB.

Adaptasi evolusioner yang cepat dalam perilaku predator

Ikan mandarin adalah predator agresif. Selama analisis genom kompleks, para peneliti mengidentifikasi apa yang disebut gen kandidat yang terkait dengan agresi yang sangat tinggi dan mempengaruhi perilaku. "Analisis genom kami menunjukkan perkembangan evolusioner ikan mandarin. Mereka telah beradaptasi dengan cepat terhadap perubahan kondisi lingkungan, terutama terkait dengan perilaku makan mereka. Saat ini, beberapa spesies ikan mandarin menjadi predator yang lebih agresif daripada yang lain karena kecenderungan genetiknya," kata Prof. Xu-Fang Liang dari HZAU.

"Penelitian tentang hubungan antara kode genetik dan perilaku makan merupakan dasar penting untuk budidaya ikan yang berkelanjutan. Di masa depan, para pembudidaya ikan akan dapat menggunakan seleksi berbasis penanda untuk memilih ikan untuk pembibitan di mana genom menunjukkan perilaku yang kurang predator – – dan dengan demikian mengurangi kerugian, "merangkum Dr. Heiner Kuhl, ahli bioinformatika terkemuka dari proyek IGB.

Penelitian genom throughput tinggi di IGB


Genom referensi untuk Siniperca chuatsi adalah salah satu genom ikan dengan kualitas terbaik hingga saat ini. Itu dianalisis menggunakan teknik sekuensing generasi ketiga dan memiliki kontinuitas urutan yang sangat tinggi dan rekonstruksi 24 kromosom yang hampir lengkap. Genom referensi berkualitas tinggi memungkinkan pengurutan yang hemat biaya dari tiga spesies lain dari famili Sinipercidae melalui genomik komparatif. Pendekatan untuk membuat urutan genom untuk seluruh keluarga taksonomi organisme ini dapat berfungsi sebagai cetak biru untuk proyek genom skala besar.

Referensi:

Bahan disediakan oleh Forschungsverbund Berlin. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

You may also like...

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.