Metode cepat dan hemat biaya untuk melacak penyebaran COVID-19 melalui air limbah yang tidak diolah – Sains Terkini

Sekelompok peneliti telah menunjukkan bahwa, dari tujuh metode yang biasa digunakan untuk menguji virus dalam air limbah yang tidak diolah, teknik ekstraksi adsorpsi dapat mendeteksi SARS-CoV-2 secara paling efisien. Ini memberi kita alat lain untuk mendeteksi keberadaan dan penyebaran pandemi COVID-19.

Pelacakan penyebaran pandemi COVID-19 saat ini dilakukan dengan pengujian sampel usap hidung atau air liur. Alat dan teknik untuk melacak penyebaran pandemi dengan cara lain akan sangat bermanfaat; Pemantauan air limbah adalah metode yang memungkinkan kami memantau penyebaran pandemi pada skala yang jauh lebih besar. Ini bukan teknik baru, dan telah digunakan untuk mendeteksi virus non-envelope, tetapi metode konvensional untuk virus yang dibungkus seperti SARS-CoV-2 belum dikembangkan.


Dalam pekerjaan saat ini, yang ditulis bersama oleh Asisten Profesor Masaaki Kitajima dari Laboratorium Teknik Pengendalian Kualitas Air di Universitas Hokkaido, para ilmuwan melaporkan metode cepat dan ekonomis untuk memusatkan virus korona dalam air limbah yang tidak diolah. Virus hepatitis Murine (MHV), sejenis virus yang menyelubungi, terkait erat dengan SARS-CoV-2 tetapi tidak memengaruhi manusia, dan karenanya aman digunakan untuk menguji kelayakan metode ini. Studi ini dipublikasikan di Ilmu Lingkungan Total.

Para ilmuwan memperoleh MHV dari kotoran tikus dan memasukkannya ke dalam sampel air limbah yang tidak diolah yang dikumpulkan dari Brisbane, Australia. Mereka berusaha memulihkan dan memusatkan MHV dari sampel ini dengan tujuh metode berbeda yang biasanya digunakan untuk menguji virus non-envelope. Jumlah MHV yang ditemukan ditentukan dengan metode yang disebut PCR transkripsi-balik-kuantitatif, di mana RNA virus diekstraksi, diubah menjadi DNA, DNA digandakan berulang kali, dan peningkatan jumlah DNA diukur selama proses.

Pemulihan paling tinggi dalam metode yang melibatkan perlakuan sampel dengan magnesium klorida dan kemudian menyaring virus pada membran bermuatan negatif; pemulihan tertinggi kedua adalah dengan metode serupa tanpa magnesium klorida. Keuntungan dari metode ini antara lain waktu pemrosesan awal di bawah 1 jam dan hanya membutuhkan peralatan dan reagen yang murah dan tersedia secara luas. Ada juga kekurangannya, seperti filter tersumbat yang dapat meningkatkan waktu pemrosesan. Namun, hingga saat ini, kebutuhan untuk reverse transcription-qPCR untuk mendeteksi virus tidak dapat dihindari.

Langkah selanjutnya adalah menguji metode ini dalam sampel yang dikumpulkan dari daerah di mana pandemi lazim. Ada dua tujuan: satu untuk menunjukkan bahwa teknik ini dapat digunakan untuk SARS-CoV-2, dan yang lainnya untuk menunjukkan bahwa tes tersebut dapat digunakan pada sampel dari luar laboratorium.


"Saya berharap penelitian ini berkontribusi pada pembentukan protokol standar untuk deteksi SARS-CoV-2 dalam air limbah," kata Asisten Profesor Kitajima, "dan ini, pada gilirannya, mempercepat penyelidikan untuk meningkatkan pemahaman kita tentang epidemiologi COVID-19 melalui pengawasan air limbah. " Dia saat ini terlibat dalam sejumlah studi terkait penerapan epidemiologi berbasis air limbah untuk melacak penyebaran pandemi COVID-19, dan telah bekerja sama dengan sejumlah ilmuwan dan kelompok penelitian di seluruh dunia dalam upaya ini.

Referensi:

Bahan disediakan oleh Universitas Hokkaido. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

You may also like...

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.