Metode fluoresensi baru mengungkapkan tanda tangan masing-masing mikroba – Sains Terkini


Ketika dilihat dengan mikroskop khusus, sel mikroba menunjukkan pola fluoresensi individu, atau tanda tangan, yang tergantung pada campuran biomolekul yang terkandung dalam sel. Campuran kompleks itu, dengan ciri khasnya, pada gilirannya tergantung pada jenis mikroba dan keadaan fisiologisnya, seperti apakah itu tumbuh atau apa yang dikonsumsi sebagai sumber makanan.

Peneliti dari Universitas Tsukuba telah mengembangkan metode baru, yang dinamai CRIF (Confocal Reflection yang dibantu dengan sel tunggal bawaan Fluoresensi Bawaan), untuk mendeteksi tanda-tanda fluoresensi sel mikroba individu. Metode ini tidak merusak, artinya sel-sel tetap hidup, dan memungkinkan sel untuk dipelajari dalam lingkungan tiga dimensi yang realistis. Yang penting, metode baru ini dapat digunakan untuk melihat sel-sel individual dalam campuran berbagai jenis mikroba, tidak seperti banyak teknik standar yang paling cocok dengan populasi "murni" di mana sel-selnya semuanya sama. Tim baru-baru ini menerbitkan temuan mereka di Mikrobiologi Terapan dan Lingkungan.

"Kami menggunakan mikroskop confocal, yang dapat menghasilkan gambar dari bahan tiga dimensi – agak seperti membandingkan urutan irisan untuk membangun gambar dari seluruh struktur utuh. Ini memungkinkan kami untuk menemukan lokasi sel mikroba dalam sampel , "kata pemimpin dan penulis koresponden Yutaka Yawata. "Menggabungkan ini dengan spektroskopi untuk mengukur satu set sinyal fluoresensi di bawah mikroskop, kami dapat melihat berbagai jenis mikroba dalam sampel, dan membaca tanda tangan mereka untuk mengidentifikasi sel-sel individual."

Tim kemudian melatih model komputer untuk membaca tanda tangan fluoresensi dan membedakan berbagai jenis sel. Model belajar mengenali sel secara otomatis, bahkan ketika melihat sel yang berbeda dengan bentuk dan ukuran yang sangat mirip, dan menganalisis gambar untuk tanda tangan sel untuk mengidentifikasi sel sesuai dengan jenis dan keadaan fisiologisnya.

"Teknik kami untuk mengenali dan melacak tanda tangan fluoresensi bawaan dari masing-masing sel individu dalam sampel tiga dimensi membuka peluang baru yang menarik untuk mengeksplorasi populasi mikroba campuran, seperti yang ditemukan di lingkungan alami," kata rekan penulis yang sama Nobuhiko Nomura. "Ini akan membantu para peneliti memahami bagaimana mikroba tumbuh dan berinteraksi satu sama lain di dunia nyata."

Referensi:

Bahan disediakan oleh Universitas Tsukuba. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjangnya.

You may also like...

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.