SARS-CoV-2 RNA terdeteksi di air limbah yang tidak diolah dari Louisiana – Sains Terkini

Sekelompok ilmuwan telah mendeteksi materi genetik dari SARS-CoV-2 dalam sampel air limbah yang tidak diolah yang dikumpulkan pada April 2020 dari dua pabrik pengolahan air limbah di Louisiana, AS.

Epidemiologi Berbasis Air Limbah (WBE) adalah proses di mana penyebaran penyakit pada populasi manusia dilacak dengan menguji air limbah. Ini telah digunakan untuk melacak penyebaran infeksi polio dan norovirus. Banyak kelompok di seluruh dunia sedang mengembangkan metode untuk mengadaptasi WBE untuk melacak COVID-19. Dengan menggunakan metode ini, SARS-CoV-2 telah terdeteksi di air limbah kota dari Australia, Spanyol, Italia, Belanda dan Jepang.


Dalam makalah yang diterbitkan di jurnal Ilmu Lingkungan Total, sekelompok peneliti – termasuk Samendra P. Sherchan dari Universitas Tulane, AS, dan Masaaki Kitajima dari Universitas Hokkaido – telah melaporkan deteksi SARS-CoV-2 RNA dalam sampel air limbah yang tidak diolah yang dikumpulkan pada April 2020 dari Louisiana selatan. Ini adalah laporan pertama pendeteksian virus di air limbah di Amerika Utara.

Sampel dikumpulkan setiap bulan antara Januari dan April 2020 dari dua instalasi pengolahan air limbah anonim, yang melayani populasi masing-masing 244.627 (IPAL A) dan 45.694 (IPAL B). Sampel termasuk air limbah yang tidak diolah, air limbah yang diolah sebelum klorinasi, dan air limbah limbah terklorinasi. Para ilmuwan berusaha memulihkan SARS-CoV-2 dari sampel ini dengan salah satu dari dua metode: ultrafiltrasi (menyaring sampel melalui filter yang sangat halus untuk mengumpulkan virus) atau elusi adsorpsi (melewatkan sampel melalui membran yang mengikat virus, dan kemudian mengumpulkan virus dengan membilasnya). Jumlah virus yang ditemukan ditentukan oleh reverse transcription-quantitative PCR, metode standar untuk menguji SARS-CoV-2.

Dari total 15 sampel, para ilmuwan mendeteksi SARS-CoV-2 hanya dalam dua sampel. Virus terdeteksi pada sampel yang diproses dengan ultrafiltrasi, tetapi tidak pada sampel yang terkonsentrasi dengan adsorpsi-elusi. Lebih lanjut, virus hanya terdeteksi di limbah yang tidak diolah, tetapi tidak di sampel air limbah yang diolah – menunjukkan bahwa pemrosesan air limbah standar mungkin cukup untuk menghilangkan dan / atau menghancurkan virus. Terakhir, virus baru terdeteksi pada sampel yang dikumpulkan pada bulan April (WWTP A pada 29 April dan WWTP B pada 8 April). Selama periode pengambilan sampel, jumlah total kasus yang dikonfirmasi di wilayah yang dilayani oleh instalasi pengolahan air limbah tertinggi di bulan ini.

Para ilmuwan menyimpulkan bahwa ultrafiltrasi adalah metode unggulan untuk pemulihan virus, tetapi faktor lain dapat mengganggu deteksi virus. Namun, pengujian lebih lanjut diperlukan pada ukuran sampel yang lebih besar untuk memahami batasan metode ini, dan untuk membandingkannya dengan metode lain yang saat ini sedang diuji untuk tujuan yang sama. Secara umum, untuk WBE COVID-19, diperlukan metode konsentrasi virus dan metode deteksi virus yang lebih baik.

"Laporan terbaru tentang deteksi SARS-CoV-2 RNA dari berbagai negara termasuk Jepang dan AS telah memvalidasi konsep WBE untuk pengawasan COVID-19," kata Masaaki Kitajima. "Saya berharap studi COVID-19 WBE akan dipercepat dalam skala global melalui kolaborasi internasional."


Asisten Profesor Kitajima saat ini terlibat dalam sejumlah penelitian terkait penerapan WBE untuk melacak penyebaran pandemi COVID-19. Dia telah bekerja sama dengan sejumlah ilmuwan dan kelompok penelitian di seluruh dunia dalam upaya ini, dan merupakan bagian dari tim yang pertama kali mendeteksi SARS-CoV-2 dalam air limbah di Jepang.

Referensi:

Bahan disediakan oleh Universitas Hokkaido. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjangnya.

You may also like...

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.